以外と見落としますが、やはりドキュメントはMSDNです。
Public Beta の執筆時点では、Windows Azure Expression EncoderとPlayReadyしか使えません。その中で使えるパラメーター文字列はこちらからになります。
MSDN: Task Presets for Windows Azure Media Services
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/hh973619
パートナー様のMediaProcessorが使えるようになると、こちらに出てくる予定ですので、楽しみに待ちましょう。